Mit der Universellen Molekularen Identifizierung ist es möglich, Proben direkt auf Mikroorganismen zu untersuchen, ohne vorab wissen zu müssen, welche und wie viele unterschiedliche Mikroorganismen enthalten sind. Der Nachweis erfolgt kultivierungsunabhängig und liefert damit einen direkten, semiquantitativen Einblick in die zu einem bestimmten Zeitpunkt vorhandene mikrobielle Gemeinschaft.
Dieses Vorgehen hat viele Vorteile:
- sämtliche Mikroorganismen in der Probe können identifiziert werden
- die Identifizierung erfolgt ohne vorherige Kenntnis über die Art der Mikroorganismen
- keine Verfälschung der mikrobiellen Gemeinschaft durch die Art der Kultivierung
- unbekannte Kontaminationskeime können eingeordnet werden
AMODIA bietet verschiedene Varianten von universellen und Gruppen-spezifischen Analysen an, die sich in ihren Zielgenen unterscheiden:
| Verfügbare Ziel-Gene für: | Bacteria | Fungi |
|---|---|---|
| universell (fett: Standardsystem) |
16S rRNA V2-V3 16S rRNA V4-V5 16S rRNA V8-V9 rpoB Silva-System* |
18S rRNA 28S rRNA ITS |
| Gruppe der Methanogenen | 16S rRNA mcrA |
|
| Gruppe der Sulfat-Reduzierer | dsrAB | |
| Gruppe der Schwefel-Oxidierer | soxB |
*: Klindworth et al. (Nucleic Acid Research, 2013, Vol. 41, No 1 e1)
Zwei Beispiele für Anwendungen für die Universelle Molekulare Identifizierung finden Sie hier mit der Analyse einer Waschmaschine bzw. Gruppen von Bakterien. Weitere mögliche Einsatzbereiche sind:
- Umweltproben, wie z.B. Gewässerproben, Trinkwasser, Bodenproben, Sedimente, Biofilme
- Proben aus geologischen Mess-Stationen
- Biogasanlagen oder Fermentation von Mischpopulationen
- Korrosionsschäden
- Industrielle Abfüll- oder Beschichtungsanlagen
- Qualitätskontrollen von Anlagen, Rohstoffen oder Produkten
- Ermittlung des Eintrags von Kontaminationen in Anlagen oder Produkte
- Überprüfung der Wirkung von Bioziden oder Hygienemaßnahmen
- Schimmelbefall auf Tapeten, Holz oder Silikonfugen
- Medizinisches Probenmaterial mit Mischinfektionen
- und viele mehr
Die Technik ist geeignet, mikrobielle Kontaminationen zu identifizieren. Sie kann damit als Ausgangspunkt für die Entwicklung eines Nachweissystems für diese Mikroorganismen dienen.
AMODIA entwickelt Gruppen-spezifische Systeme im Kundenauftrag. Sprechen Sie uns darauf an!
Die Technik ist geeignet, mikrobielle Kontaminationen zu identifizieren. Sie kann damit als Ausgangspunkt für die Entwicklung eines Nachweissystems für diese Mikroorganismen dienen. Wir beraten Sie gerne.
Weitere Informationen erhalten Sie hier: