Mit Hilfe von Stamm-Typisierungen können Stämme gleicher Spezies differenziert werden. Wir differenzieren Isolate der gleichen Spezies mit speziellen PCR-Techniken.

Typische Anwendungen für die Typisierung sind:

• Überprüfung der Identität von Produktionsstämmen
• Überprüfung der Identität von Referenzstämmen
• Identifizierung der Quelle von Kontaminationskeimen
• Gruppierung eigener Isolate / Phylogenetische Analysen

Je nach Mikroorganismus kommen unterschiedliche Methoden zur Stammtypisierung zum Einsatz:

• Bakterien: DAF-PCR oder ERIC-PCR
• Eukaryonten: Mikrosatelliten-PCR

Neben den zu testenden Isolaten ist jeweils ein definiertes Referenz-Isolat nötig. Die Produkte der PCR werden auf Acrylamidgelen aufgetrennt (s. Abb.) und mit einem Programm zur densitometrischen Auswertung analysiert. Bei mehreren Isolaten kann zusätzlich auch ein phylogenetischer Baum zur Visualisierung der genetischen Ähnlichkeiten erstellt werden.